Sci Rep:5-miRNA标签特征可作为食管鳞状细胞膜癌的预后生物标志物

2021-12-20 00:59:38 来源:
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这项数据分析意在确定一种可以预期冠状动脉鳞状细胞癌症(ESCC)高血压基本上生存率(OS)的miRNAs标识。

从NCBI GEO获取119名ESCC高血压的miRNA暗示谱及其相应的临床信息,并将其作为受训集。在一时期和后期样本之间择优区别暗示的miRNAs(DEmiRNAs)。使用Cox回归归纳、闭包特点消除(RFE)-支持者向量机(SVM)算法和LASSO Cox回归数学模型来识别结节病官能miRNAs,从而建立结节病打分数学模型。此外,预期了这些结节病官能miRNAs的有前途靶遗传物质,然后构建了miRNA靶遗传物质网络服务。通过功能富集归纳,归纳了ESCC当中这些结节病官能miRNAs预期靶遗传物质的功能表征。

在受训集当中,一时期与后期样本有46个DEmiRNAs。建立了基于5个miRNAs的几率打分数学模型。该5-miRNA几率打分可以将受训集分为OS时之间明显完全相同的高危组和低危组。在一个来自前列腺癌症遗传物质组图谱(TCGA)的单一数据集当中,成功验证了5-miRNA几率打分的几率分层能力。已确定了与这些miRNAs相关的各种生物科学过程和移动式,例如Wnt信号移动式、TRP通道的病变介质平衡移动式和睾酮信号移动式。

这项数据分析定时,与病理分期相关的5-miRNA标识对预期ESCC高血压的结节病不具临床意义。

原始出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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